Uniwersytet Warszawski, Wydział Nauk Ekonomicznych - Centralny System Uwierzytelniania

Bioinformatyka

Informacje ogólne

Kod przedmiotu:	1400-216BINF
Kod Erasmus / ISCED:	11.304 Kod klasyfikacyjny przedmiotu składa się z trzech do pięciu cyfr, przy czym trzy pierwsze oznaczają klasyfikację dziedziny wg. Listy kodów dziedzin obowiązującej w programie Socrates/Erasmus, czwarta (dotąd na ogół 0) – ewentualne uszczegółowienie informacji o dyscyplinie, piąta – stopień zaawansowania przedmiotu ustalony na podstawie roku studiów, dla którego przedmiot jest przeznaczony. / (0612) Database and network design and administration Kod ISCED - Międzynarodowa Standardowa Klasyfikacja Kształcenia (International Standard Classification of Education) została opracowana przez UNESCO.
Nazwa przedmiotu:	Bioinformatyka
Jednostka:	Wydział Biologii
Grupy:	Przedmioty obowiązkowe, BIOTECHNOLOGIA, II rok, I stopień
Punkty ECTS i inne:	6.00 Podstawowe informacje o zasadach przyporządkowania punktów ECTS: roczny wymiar godzinowy nakładu pracy studenta konieczny do osiągnięcia zakładanych efektów uczenia się dla danego etapu studiów wynosi 1500-1800 h, co odpowiada 60 ECTS; tygodniowy wymiar godzinowy nakładu pracy studenta wynosi 45 h; 1 punkt ECTS odpowiada 25-30 godzinom pracy studenta potrzebnej do osiągnięcia zakładanych efektów uczenia się; tygodniowy nakład pracy studenta konieczny do osiągnięcia zakładanych efektów uczenia się pozwala uzyskać 1,5 ECTS; nakład pracy potrzebny do zaliczenia przedmiotu, któremu przypisano 3 ECTS, stanowi 10% semestralnego obciążenia studenta. zobacz reguły punktacji
Język prowadzenia:	polski
Rodzaj przedmiotu:	obowiązkowe
Skrócony opis:	Przegląd podstawowych metod i narzędzi bioinformatycznych z nauką praktycznych umiejętności korzystania z oprogramowania
Pełny opis:	1. Wstęp do bioinformatyki. Bazy danych dla Biologii Molekularnej i Biotechnologii - przegląd. 2. Środowisko pakietu GCG. Podstawowe operacje. Przeszukiwanie baz danych przy pomocy słów kluczowych. 3. Porównywanie dwu sekwencji nukleotydowych i aminokwasowych. Przeszukiwanie baz danych sekwencji nukleotydowych i aminokwasowych przy użyciu sekwencji jako zapytań. 4. Porównywanie wielu sekwencji. Analiza rodzin białek, reprezentacja rodziny i przeszukiwanie baz danych przy pomocy profilu sekwencji. 5. Motywy sekwencji związane z funkcją. Motywy rodzin białek, sygnały segregacji do przedziałów komórki, sekwencji kontrolujące ekspresję genów. 6. Zaawansowane operacje programu GCG. Odróżnianie kodujących i niekodujących sekwencji DNA. 7. Ewolucja molekularna. Obsługa pakietu PHYLIP. 8. Sequence Retrieval System - relacyjna baza danych sekwencji. 9. PDB - baza struktur przestrzennych makrocząstek. Grafika molekularna. 10. Modelowanie struktur białek globularnych. 11. Serwery biologiczne w Internecie. 12. Samodzielne rozwiązanie przykładowego, złożonego problemu.

Zajęcia w cyklu "Semestr letni 2022/23" (w trakcie)

Okres:	2023-02-20 - 2023-06-18	Wybrany podział planu: ten tydzień cykl przedmiotu zobacz plan zajęć
Typ zajęć:	Ćwiczenia, 60 godzin więcej informacji Wykład, 30 godzin więcej informacji
Koordynatorzy:	Norbert Odolczyk, Piotr Zielenkiewicz
Prowadzący grup:	Maciej Kotliński, Norbert Odolczyk, Piotr Zielenkiewicz, Maksymilian Zienkiewicz
Lista studentów:	(nie masz dostępu)
Zaliczenie:	Przedmiot - Egzamin Ćwiczenia - Zaliczenie na ocenę Wykład - Egzamin

Opisy przedmiotów w USOS i USOSweb są chronione prawem autorskim.
Właścicielem praw autorskich jest Uniwersytet Warszawski, Wydział Nauk Ekonomicznych.