Molekularne podstawy enzymologii
Informacje ogólne
Kod przedmiotu: | 1000-714bMPE |
Kod Erasmus / ISCED: |
13.6
|
Nazwa przedmiotu: | Molekularne podstawy enzymologii |
Jednostka: | Wydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki |
Grupy: |
Przedmioty obowiązkowe dla II roku bioinformatyki |
Punkty ECTS i inne: |
3.50
|
Język prowadzenia: | polski |
Rodzaj przedmiotu: | obowiązkowe |
Skrócony opis: |
W ramach wykładu studenci zapoznają się z budową białek enzymatycznych, mechanizmami katalizy oraz kinetyką enzymatyczną. W części laboratoryjnej zostaną przedstawione techniki i metody przydatne w pracy z enzymami w warunkach in vitro i in silico. |
Pełny opis: |
WYKŁAD: Treści kształcenia: Podstawy termodynamiki chemicznej, budowa białek enzymatycznych, mechanizmy katalizy enzymatycznej, typy kinetyki reakcji enzymatycznych, rodzaje reakcji katalitycznych i klasyfikacja enzymów, błonowe układy bioenergetyczne. ĆWICZENIA: W skład zajęć wchodzą następujące zadania rachunkowe, laboratoryjne i komputerowe: 1.Przeliczenia biochemiczne i enzymatyczne. Podstawy spektrofotometrii 2. Podstawy symulacji reakcji chemicznych i enzymatycznych przy użyciu programów komputerowych 3. Podstawy pomiarów reakcji enzymatycznych. Oznaczanie aktywności aminotransferaz w surowicy krwi królika. 4. Pomiary kinetyki enzymatycznej dla dehydrogenazy L-mleczanowej 5. Rachunkowe metody wyznaczania parametrów kinetycznych enzymów. 6. Hamowanie reakcji enzymatycznych – symulacje w programach komputerowych oraz analiza danych 7. Mechanizmy reakcji enzymatycznych – symulacje w programach komputerowych oraz analiza danych 8. Zastosowanie programów komputerowych do analizy budowy przestrzennej enzymów. |
Literatura: |
J.M Berg, J.L. Tymoczko, L. Stryer. Biochemia, Rozdziały 3,4, 8-10, PWN, Warszawa 2005 S. Strumiło, A. Tylicki. Enzymologia Podstawy, PWN, Warszawa 2020 A. Zgirski, R. Gondko Obliczenia Biochemiczne, PWN, Warszawa 1998 A. Cornish-Bowden. Fundamentals of Enzyme Kinetics, 4th Edition. Elsevier, 2014 https://iubmb.qmul.ac.uk https://www.gepasi.org https://copasi.org/ |
Efekty uczenia się: |
Wiedza: *Student ma opanowaną wiedzę o budowie i funkcjonowaniu enzymów (K_W04) *Student ma opanowaną wiedzę na temat podstaw fizykochemicznych katalizy enzymatycznej (K_W01) Umiejętności: *Student potrafi stosować podstawowe techniki i narzędzia badawcze w zakresie biologii ze szczególnym uwzględnieniem biochemii, fizyki i biologii molekularnej (K_U02) *Student potrafi opisywać systemy informatyczne i bioinformatyczne w sposób zrozumiały dla laika (K_U14) Kompetencje: *Student jest przygotowany do precyzyjnego formułowania pytań, służących pogłębieniu własnego zrozumienia danego tematu lub odnalezieniu brakujących elementów rozumowania (K_K02) *Student jest przygotowany do samodzielnego wyszukiwania informacji w literaturze i zasobach internetowych, także w językach obcych (K_K03) |
Metody i kryteria oceniania: |
Sprawozdania z ćwiczeń oraz egzamin pisemny obejmujący wiedzę z wykładów |
Zajęcia w cyklu "Semestr letni 2024/25" (w trakcie)
Okres: | 2025-02-17 - 2025-06-08 |
Przejdź do planu
PN WT WYK
CW
CW
ŚR CZ CW
CW
PT |
Typ zajęć: |
Ćwiczenia, 30 godzin
Wykład, 15 godzin
|
|
Koordynatorzy: | Radosław Mazur | |
Prowadzący grup: | Maciej Garstka, Radosław Mazur | |
Lista studentów: | (nie masz dostępu) | |
Zaliczenie: | Egzamin |
Właścicielem praw autorskich jest Uniwersytet Warszawski, Wydział Nauk Ekonomicznych.